More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4041 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  248  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  74.17 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  76.99 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  68.7 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  62.6 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  59.26 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  57.41 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  53.1 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  60.95 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  50.93 
 
 		 124 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  47.93 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  48.7 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  58.42 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  52.54 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  56.73 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  47.9 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  48.33 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  53.91 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  51.35 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  56 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  53.92 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  53.92 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  51.4 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 182 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  50.5 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  41.96 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  44.66 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  47 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  51.85 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  39.17 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  40 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  36.79 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  40 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 696 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  43.82 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1036 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 688 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 1651 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  39.25 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 695 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.86 
 
 		 695 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 173 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 705 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1646 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 699 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  46.05 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 581 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 589 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  39.81 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1631 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 589 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 727 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  37.39 
 
 		 845 aa  73.6  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 727 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  34.78 
 
 		 949 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 949 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39.82 
 
 		 529 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1011 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>