More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2999 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  80.39 
 
 		 405 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  85.01 
 
 		 417 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  75.25 
 
 		 422 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  31.22 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.96 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  27.2 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.15 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  30.71 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  29.53 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.65 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  28.31 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.09 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.4 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.53 
 
 		 480 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 433 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 432 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 400 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.01 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  32 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  27.62 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>