171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1406 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  95.88 
 
 		 170 aa  304  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  84.21 
 
 		 171 aa  287  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  81.76 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  76.97 
 
 		 171 aa  227  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  68.67 
 
 		 169 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  67.66 
 
 		 168 aa  216  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  54.17 
 
 		 180 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  49.67 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  49.01 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  48.3 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  48.34 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  43.12 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  50.72 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  50.72 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  42.86 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  37.11 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  43.65 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  38.67 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  35.44 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  35.44 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  34.44 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  36.15 
 
 		 335 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.78 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  34.35 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  32.17 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  35 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.83 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  30.33 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  35.04 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  35.04 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  32.77 
 
 		 541 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  34.17 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.71 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  34.86 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.77 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  32.54 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  37.29 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.29 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  30.83 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  34.29 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.93 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  32.46 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  31.48 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  29.57 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  32.17 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  29.7 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  33.06 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  30.25 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.21 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  29.09 
 
 		 293 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  31.09 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  29.86 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  24.37 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  32 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.08 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  29.52 
 
 		 294 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.91 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  32.29 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  32.43 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  28.18 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  30.56 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30.56 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  29.57 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  32.67 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  28.48 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  27.27 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  27.59 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  29.27 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  30.12 
 
 		 282 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  29.06 
 
 		 300 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.81 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  30.23 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  28.7 
 
 		 301 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  29.09 
 
 		 276 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  25.95 
 
 		 242 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.41 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  27.64 
 
 		 255 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  30 
 
 		 244 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  30.36 
 
 		 283 aa  51.2  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.82 
 
 		 260 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  23.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  34.78 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  27.67 
 
 		 188 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  27.5 
 
 		 305 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  28.18 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  28.18 
 
 		 270 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  28.18 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  28.18 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  28.18 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  28.18 
 
 		 275 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  26.52 
 
 		 500 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>