More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2397 on replicon NC_009516
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  66.17 
 
 		 210 aa  291  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  67.16 
 
 		 205 aa  283  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  64.68 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  50.5 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  55.17 
 
 		 208 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  53.08 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  55.67 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  52.74 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  52.74 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  52.74 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  56 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  50.24 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  48.5 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  49.75 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  47.64 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  47.8 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  49.01 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  48.26 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  51.72 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  48.24 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.74 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  47.76 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  46.77 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  47.26 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  46.77 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  49.71 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  47.67 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  46.63 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  46.26 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  43.84 
 
 		 228 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  44.32 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  66.04 
 
 		 138 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  43.29 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  42.07 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  37.02 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  36.23 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  41.77 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.35 
 
 		 283 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  43.96 
 
 		 102 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  44.44 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  29.8 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  87.18 
 
 		 41 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  34.55 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  29.47 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  30.92 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.72 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  29.45 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  30.16 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  32.07 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  32.93 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  28.86 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  27.18 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  32.08 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  28.22 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  29.88 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  33.33 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  30.95 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  27.55 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  27.55 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  32.12 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  25.98 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  29.27 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  30.36 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  29.45 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  29.34 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  29.34 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  29.06 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  29.06 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  29.34 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  28.9 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  34.55 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  26.77 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  30.81 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  35.96 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0127  resolvase family site-specific recombinase  46.05 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.364122  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  31.76 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>