More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1756 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1756  peptidase M23B  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657093  decreased coverage  0.0000000551494 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  58.82 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  58.33 
 
 		 272 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  35.95 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.57 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  36.99 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  35.52 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  34.2 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  34.98 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  37.05 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  33.21 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  38.01 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  35.83 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.14 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  37.23 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.1 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  36.09 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.18 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  35.51 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  33.94 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  39.64 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  32.7 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  36.36 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  36.13 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  35.32 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  33.85 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  37.94 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  32.34 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  37.04 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  37.73 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  37.04 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  37.04 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  37.04 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  37.04 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  37.04 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  35.08 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  34.55 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  32.85 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  33.88 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  34.07 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  34.42 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  34.42 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  37.5 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.1 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  35.54 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  35.54 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  35.54 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  35.08 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  30.65 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  31.73 
 
 		 315 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  33.9 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  33.06 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  38.76 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  35.68 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  35.68 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  36.28 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  33.77 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  32.81 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.35 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.8 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  32.81 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  33.63 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  32.12 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  31.8 
 
 		 230 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  33.46 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  31.29 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  31.45 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  33.05 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  33.47 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  33.47 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  32.41 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  33.47 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  33.47 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  36.5 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  33.47 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  31.93 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  34.67 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  31.8 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  34.67 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  34.67 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  31.93 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  34.67 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  34.67 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  34.67 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  36.44 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  34.67 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  31.93 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  31.93 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  31.93 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  31.93 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  33.62 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  33.46 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  33.08 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  34.04 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  31.06 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  29.9 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  28.31 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  33.74 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  30.48 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>