More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2227 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 493 aa  996    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  54.3 
 
 		 516 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  47.56 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  46.14 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.02 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.02 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.22 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 518 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  40.16 
 
 		 518 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.01 
 
 		 460 aa  348  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  40.94 
 
 		 463 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.51 
 
 		 455 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.01 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.6 
 
 		 512 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.9 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.33 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.13 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.8 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.92 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  41.92 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  41.92 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  41.92 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.92 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.92 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.39 
 
 		 467 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.72 
 
 		 467 aa  322  8e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.19 
 
 		 467 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.39 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.39 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.55 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.19 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  39.8 
 
 		 465 aa  315  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  42.07 
 
 		 472 aa  312  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.57 
 
 		 495 aa  299  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  35.9 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  35.28 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 488 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  34.76 
 
 		 529 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  42.68 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 527 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  40.14 
 
 		 558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  39.04 
 
 		 593 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  36.91 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  36.65 
 
 		 592 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 723 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  34.61 
 
 		 495 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  35.29 
 
 		 463 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  38.72 
 
 		 473 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  35 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.63 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  35.48 
 
 		 356 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 510 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.9 
 
 		 464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  35.22 
 
 		 360 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  37.74 
 
 		 549 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.39 
 
 		 1162 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  34.12 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.64 
 
 		 518 aa  177  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 394 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 396 aa  177  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 465 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  29.26 
 
 		 465 aa  176  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  34.98 
 
 		 369 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2934  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0322426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 385 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  37.55 
 
 		 594 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.14 
 
 		 496 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  33.33 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>