268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1689 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  64.14 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  57.72 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  57.72 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  59.31 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  59.03 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  56.08 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  51.75 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  52.35 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  52.67 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  51.35 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  58.9 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  51.61 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  53.33 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  52.35 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  51.3 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  55.41 
 
 		 161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  52.03 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  52.03 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  55.56 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  48.61 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  54.47 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  57.52 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  62.16 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  53.66 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  60.36 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  39.47 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  60.36 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  57.02 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  46.9 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  49.66 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  59.26 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  59.29 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  57.89 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  58.41 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  51.59 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  52.76 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  52.76 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  56.64 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  59.26 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  44.59 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  53.72 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  58.47 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  54.1 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  53.72 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  49.57 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  54.05 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  54.46 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  55.08 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.35 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  53.15 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  54.46 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  53.78 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  55.14 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  52.73 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  50.91 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  54.55 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  49.22 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  49.22 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  49.22 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  47.66 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  50.86 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  53.04 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  51.28 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  54.46 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  54.55 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  42.95 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  52.73 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  53.04 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  53.15 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  52.73 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  51.24 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  42.67 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.82 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  48.62 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  49.57 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>