267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0848 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 137 aa  264  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  75.18 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  70 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  67.13 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  63.57 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  62.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  66.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  68.31 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  67.61 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  60.58 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  69.72 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  61.43 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  63.12 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  67.14 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  65.73 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  65.73 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  65.73 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  65.03 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  65.03 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  66.43 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  64.29 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  65.03 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  56.93 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  63.12 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  63.89 
 
 		 199 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  55.64 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  64.08 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  64.08 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  61.31 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  57.66 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  65.03 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  57.66 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  58.09 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  58.09 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  57.66 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  53.28 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  56.62 
 
 		 137 aa  149  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  61.7 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  55.47 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  58.99 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  60.28 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  55.56 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  58.16 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  56.93 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  56.93 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  58.7 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  56.39 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  63.97 
 
 		 148 aa  146  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  59.2 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  62.94 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  57.45 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  56.03 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  56.39 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  59.26 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  55.4 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  55.47 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  59.31 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  53.96 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  51.49 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  60.34 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  59.31 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  54.29 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  52.52 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  52.17 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  57.24 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  50.68 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  53.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  50.68 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  57.75 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  53.47 
 
 		 155 aa  126  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  60.19 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  50.72 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.03 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>