52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0517 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  54.8 
 
 		 1231 aa  895    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  51.49 
 
 		 1118 aa  1056    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  51.44 
 
 		 1118 aa  1040    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  43.34 
 
 		 1186 aa  766    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  46.16 
 
 		 1164 aa  753    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  42.06 
 
 		 1173 aa  765    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  55.7 
 
 		 1128 aa  1118    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  42.09 
 
 		 1172 aa  801    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  55.03 
 
 		 1229 aa  903    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  44.47 
 
 		 1253 aa  817    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  51.66 
 
 		 1153 aa  1093    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  43.92 
 
 		 1214 aa  848    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  46.71 
 
 		 1167 aa  750    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  40.49 
 
 		 1201 aa  803    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  51.76 
 
 		 1202 aa  834    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  52.38 
 
 		 1181 aa  1061    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  51.34 
 
 		 1193 aa  1056    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  47.7 
 
 		 1101 aa  874    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  41.93 
 
 		 1165 aa  795    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  40.54 
 
 		 1144 aa  780    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 1177 aa  2401    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 492 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 482 aa  155  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  28.99 
 
 		 485 aa  154  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 484 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  28.71 
 
 		 493 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 493 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 493 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  26.75 
 
 		 493 aa  135  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 481 aa  132  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  24.08 
 
 		 480 aa  132  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  24.28 
 
 		 513 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  25.61 
 
 		 505 aa  128  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  24.08 
 
 		 480 aa  121  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  24.75 
 
 		 481 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 497 aa  109  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  22.25 
 
 		 467 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  25.5 
 
 		 558 aa  53.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 426 aa  51.6  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  21.09 
 
 		 460 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  22.14 
 
 		 552 aa  49.7  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  19.17 
 
 		 478 aa  49.3  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.28 
 
 		 556 aa  47.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 		 422 aa  48.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  30.69 
 
 		 426 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  21.59 
 
 		 574 aa  47  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  27.45 
 
 		 422 aa  47.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.27 
 
 		 1094 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  30.27 
 
 		 1094 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 		 680 aa  46.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  30.39 
 
 		 752 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>