144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2229 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  100 
 
 		 429 aa  893    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  61.61 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  60.56 
 
 		 430 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  46.3 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  47.1 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  45.58 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  45.52 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  45.63 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  44.79 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  42.13 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  38.15 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  42.08 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  40.36 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  30.73 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  32.73 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.95 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  31.37 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.01 
 
 		 380 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  31.97 
 
 		 419 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  30.05 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.15 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.15 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  31.01 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  28.75 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  28.83 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  36.32 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.19 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  27.05 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.91 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  27.87 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  27.09 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  27.81 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  24.52 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.39 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  25.78 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.62 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  22.97 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  25.65 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.72 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.68 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  26.93 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  24.59 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.53 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  25.3 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  24.8 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.27 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  22.95 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  28.66 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  24.7 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.58 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.3 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.07 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.78 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  23.51 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  24.55 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  25.44 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  26.07 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  27.45 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  24.4 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  25.82 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  23.68 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  23.14 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  29.57 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  26.21 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  25.86 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  24.43 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  25.13 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  23.92 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.46 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  22.97 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  21.67 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  24.57 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  29.55 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.36 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  22.07 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  29.56 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  28.74 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  29.56 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  23.77 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  20.72 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  21.96 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  25 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.86 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  22.26 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  22.04 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  26.42 
 
 		 318 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.88 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  29.1 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.79 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  26.01 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  23.58 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  24.12 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>