More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2872 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  83.33 
 
 		 331 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  79.19 
 
 		 337 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  78.86 
 
 		 344 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  78.86 
 
 		 341 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  72.59 
 
 		 327 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  75.23 
 
 		 329 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  71.14 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  60.6 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  60.66 
 
 		 343 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  68.23 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  64.09 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1349  hypothetical protein  51.08 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  50.49 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  50.49 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0601  hypothetical protein  49.27 
 
 		 275 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.17 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.59 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.52 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  49.01 
 
 		 333 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.91 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.87 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.72 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.64 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  45.12 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.03 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.42 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.46 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.26 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.79 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.1 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.81 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.1 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.3 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.11 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.48 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  42.99 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.1 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.75 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.12 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.48 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  44.56 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.38 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.38 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  44.56 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.73 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.93 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.85 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.33 
 
 		 344 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.19 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.55 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.43 
 
 		 330 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.49 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.08 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.3 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.97 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  43.92 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  43.18 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.38 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.55 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.54 
 
 		 338 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.14 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.81 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  40.92 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  42.55 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  40.8 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  42.47 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  42.71 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.41 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.77 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  41.78 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  41.36 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.69 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.33 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.27 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  40.36 
 
 		 332 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  40.94 
 
 		 474 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  43.25 
 
 		 327 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  41.47 
 
 		 323 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 328 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  38.65 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  41.08 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.8 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.28 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>