More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2687 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  70 
 
 
293 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  57.39 
 
 
296 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  57.39 
 
 
296 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  59.62 
 
 
300 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  50.87 
 
 
313 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  51.18 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 
284 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
298 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  32.71 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.02 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.22 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.02 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.81 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.62 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.62 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.62 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  24.62 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.62 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.62 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.96 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.48 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.78 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.92 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.66 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.65 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.67 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 
374 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.4 
 
 
571 aa  62.8  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.09 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
262 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  32.52 
 
 
326 aa  62.4  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.43 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.5 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.11 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>