107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0522 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  877    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  32.01 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.8 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  29.28 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  33.5 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.49 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  30.57 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  29.62 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 464 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.57 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.43 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 453 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.21 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  28.11 
 
 		 491 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  25.6 
 
 		 445 aa  145  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.71 
 
 		 624 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  27.57 
 
 		 478 aa  143  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.23 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  29.19 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  26.42 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.29 
 
 		 600 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  25.39 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  26.88 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  26.64 
 
 		 672 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.06 
 
 		 606 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.17 
 
 		 758 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  21.5 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  22.33 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.29 
 
 		 641 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  22.14 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  26.91 
 
 		 748 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  22.25 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.57 
 
 		 757 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  27.49 
 
 		 764 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 		 411 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.22 
 
 		 600 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  24.94 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  24.69 
 
 		 797 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  23.79 
 
 		 761 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  22.04 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.54 
 
 		 722 aa  89.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  21.55 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  25.18 
 
 		 763 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  24.94 
 
 		 784 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  33.05 
 
 		 764 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.53 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.37 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  21.97 
 
 		 595 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.45 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  26.01 
 
 		 680 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  25.33 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.8 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  26.61 
 
 		 619 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  58.97 
 
 		 525 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.94 
 
 		 509 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  26.39 
 
 		 543 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  27.03 
 
 		 669 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1659  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  26.4 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.43155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.35 
 
 		 660 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.35 
 
 		 660 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.73 
 
 		 540 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  29.63 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  25 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  52.78 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  23.93 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5741  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.81 
 
 		 632 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515421  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  35.82 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  22.97 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5610  glucose-inhibited division protein A  27.97 
 
 		 630 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1838  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.35 
 
 		 671 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00433  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.01 
 
 		 631 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 73 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.18 
 
 		 667 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.107762 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002019  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.74 
 
 		 631 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  21.6 
 
 		 625 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  22.89 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.53 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  38.18 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>