193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3784 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  73.45 
 
 		 253 aa  328  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  67.98 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  65.61 
 
 		 253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  61.26 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  61.26 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  63.64 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  64.43 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  63.24 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  40.4 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  39.83 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  46.55 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  37.23 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  41.11 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  45.79 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  38.49 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  40.59 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  34.52 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  43.03 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  39.04 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  42.78 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  40.7 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  42.37 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.24 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  40.24 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.91 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.23 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  31.78 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.81 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.69 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  35.05 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.98 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.03 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.04 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.82 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  31.9 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.64 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  35.67 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.46 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.71 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.71 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  49.15 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  36.57 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.5 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.98 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  37.12 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  24.15 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  44.44 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  34.42 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.31 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.64 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  26.56 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  32.33 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  31.33 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  29.68 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  43.33 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  32.33 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  28.83 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  27.38 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.52 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  30.04 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  38.1 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  32.35 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  32.35 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30.61 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  30.54 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.67 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  30.54 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  40.29 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  38.33 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  36.03 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  30.54 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  29.81 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  30.54 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  39.02 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  27.13 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  24.79 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  33.82 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  34.02 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  23.48 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  31.91 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.6 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  29.02 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  36.73 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  29.02 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>