121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3586 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1077 aa  2167    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.01 
 
 		 1000 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  30.63 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 927 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 268 aa  62.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 265 aa  62  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  25.75 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 287 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  20.75 
 
 		 2059 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  26.29 
 
 		 719 aa  57.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  27.05 
 
 		 274 aa  57.4  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1108 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.83 
 
 		 249 aa  55.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.4 
 
 		 256 aa  56.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.27 
 
 		 239 aa  55.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 252 aa  54.7  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  22.71 
 
 		 715 aa  54.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.97 
 
 		 256 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  35.63 
 
 		 284 aa  53.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 934 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  26.36 
 
 		 260 aa  53.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 1012 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  25.4 
 
 		 304 aa  52.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.08 
 
 		 884 aa  52.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 265 aa  52.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.67 
 
 		 262 aa  52.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 481 aa  52.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 275 aa  51.6  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 1178 aa  51.2  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  25.91 
 
 		 254 aa  51.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 257 aa  50.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 271 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1127 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  19.95 
 
 		 1024 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  26.13 
 
 		 259 aa  50.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.74 
 
 		 1077 aa  50.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.93 
 
 		 249 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  28.7 
 
 		 275 aa  50.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1304  hypothetical protein  29.27 
 
 		 982 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  23.31 
 
 		 285 aa  49.7  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 312 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 827 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 262 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 262 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 262 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 262 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  28.44 
 
 		 614 aa  49.3  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 263 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 262 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  26.42 
 
 		 265 aa  49.3  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 325 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  29.31 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  27.1 
 
 		 323 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 698 aa  48.5  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 252 aa  48.5  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  33.02 
 
 		 255 aa  48.5  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  33.8 
 
 		 263 aa  48.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 263 aa  47.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 804 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  27.45 
 
 		 267 aa  48.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 942 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 264 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 253 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.72 
 
 		 265 aa  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 264 aa  47.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 458 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  28.04 
 
 		 301 aa  47.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.95 
 
 		 280 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.98 
 
 		 248 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  20.13 
 
 		 1031 aa  48.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2596  hypothetical protein  24.56 
 
 		 320 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  25.42 
 
 		 249 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  23.76 
 
 		 268 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  20.93 
 
 		 1005 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  26.27 
 
 		 249 aa  47.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.42 
 
 		 222 aa  46.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  23.97 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  23.97 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  23.97 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  23.97 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  23.97 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1004 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 4079 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 229 aa  46.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  23.97 
 
 		 234 aa  46.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.12 
 
 		 1979 aa  46.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 308 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  21.33 
 
 		 268 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>