53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2416 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  42.86 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  43.88 
 
 		 156 aa  91.7  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  42 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  43 
 
 		 804 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  40.82 
 
 		 276 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  42.86 
 
 		 274 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  43.62 
 
 		 438 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  43.62 
 
 		 379 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  42.7 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  36.36 
 
 		 506 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  41.84 
 
 		 668 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  42 
 
 		 150 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  40.62 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  41.59 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  36.11 
 
 		 489 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  43 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  39.42 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  33 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  35 
 
 		 472 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  36.08 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  31.48 
 
 		 604 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  39.39 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  37.36 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.82 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  36.45 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  35 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  35 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  31.96 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  31.78 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  37.8 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  30.53 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  31.63 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  40.48 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  32.5 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  35.06 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  33.72 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.62 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  29.91 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  26.09 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.96 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1446  hypothetical protein  34.02 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  29.01 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  33.77 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  41.38 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.78 
 
 		 112 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  39.44 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  33.8 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  25.58 
 
 		 122 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  28.41 
 
 		 823 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0968  hypothetical protein  28.28 
 
 		 545 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  28.04 
 
 		 702 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>