40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2223 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 
399 aa  828    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  37.71 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.33 
 
 
397 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  30.75 
 
 
391 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  30.95 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  32.17 
 
 
425 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  31.54 
 
 
392 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  27.73 
 
 
421 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  29.53 
 
 
1015 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  29.86 
 
 
978 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  30.46 
 
 
419 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 
549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  28.64 
 
 
515 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  28.65 
 
 
949 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  29.28 
 
 
367 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.77 
 
 
523 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  26.09 
 
 
509 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  26.29 
 
 
526 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.79 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  30.14 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  26.75 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  26.18 
 
 
589 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.11 
 
 
472 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  27.25 
 
 
558 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  28.49 
 
 
674 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  27.08 
 
 
694 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  27.21 
 
 
1173 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.15 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  26.09 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  27.24 
 
 
816 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  26.82 
 
 
652 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  28.44 
 
 
807 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  23.76 
 
 
583 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  25.77 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  25 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  24.46 
 
 
823 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25.6 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  24.57 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  25.38 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  26.02 
 
 
668 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>