157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0807 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  33.98 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  35.57 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  29.45 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  28.01 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  27.87 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.77 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.67 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  23.89 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  23.66 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.47 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  23.99 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  26.39 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  24.32 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.95 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 362 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 334 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  22.87 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  23.59 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 333 aa  52.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  24.84 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  27.2 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>