More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3087 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3087  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  523  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0787215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  87.01 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  87.01 
 
 		 254 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4551  regulatory protein IclR  57.54 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  55.24 
 
 		 261 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  38.59 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6681  IclR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2989  regulatory protein IclR  30.92 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  32.97 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  24.49 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  24.31 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  25.71 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  25.93 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.93 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.36 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.56 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  24.58 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  23.98 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  22.51 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  22.77 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  27.74 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  24.9 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.09 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3730  regulatory protein IclR  26 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.619654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  28.19 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  22.82 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  24.84 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  22.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  24.69 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  26.82 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  24.9 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  23.77 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>