More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0529 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.32 
 
 		 677 aa  946    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.37 
 
 		 644 aa  940    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.724579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4936  methyl-accepting chemotaxis protein  81.37 
 
 		 644 aa  974    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0578  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  81.52 
 
 		 644 aa  937    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.73 
 
 		 644 aa  895    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0529  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 673 aa  1327    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.37 
 
 		 644 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61 
 
 		 644 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.939585  hitchhiker  0.000667074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 564 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 559 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 		 544 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 666 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  38.1 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 		 637 aa  171  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 634 aa  170  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 665 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 630 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.82 
 
 		 553 aa  167  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 630 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.03 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 714 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.28 
 
 		 554 aa  165  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.54 
 
 		 714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33.88 
 
 		 634 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 		 560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 555 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  40.52 
 
 		 545 aa  164  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.61 
 
 		 674 aa  164  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 638 aa  163  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  39.72 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 630 aa  163  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  33.82 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  36.64 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 634 aa  162  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 		 560 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 		 554 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.99 
 
 		 712 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  31.91 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  37.24 
 
 		 714 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  43.89 
 
 		 545 aa  160  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 658 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  37.65 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 		 558 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  32.69 
 
 		 578 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  37.9 
 
 		 545 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  37.63 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.34 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  35.99 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 541 aa  158  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 573 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.93 
 
 		 543 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 		 667 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  37.35 
 
 		 561 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 		 667 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 667 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  39.85 
 
 		 697 aa  157  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 		 667 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 		 667 aa  156  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 		 715 aa  157  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 		 667 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 674 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.64 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 714 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.89 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 667 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 667 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 549 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 		 688 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 		 543 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 716 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 554 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 		 673 aa  154  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 541 aa  154  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 630 aa  153  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 		 633 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 539 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>