More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3955 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  61.36 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  60.46 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  57.14 
 
 		 331 aa  358  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  60.84 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  60.52 
 
 		 311 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  59.67 
 
 		 310 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  56.44 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  55.34 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  56.52 
 
 		 310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  52.58 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  55.22 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  54.22 
 
 		 314 aa  318  9e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  53.62 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  54.14 
 
 		 309 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  52.38 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  51.02 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  45.64 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  41.78 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  39.14 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  44.02 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  46.69 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39.46 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39.46 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  43.8 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.6 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.6 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.6 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 266 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.17 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  33.85 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.2 
 
 		 275 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  46.02 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  39.67 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.44 
 
 		 282 aa  95.9  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  33.66 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  45.13 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.32 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  32.91 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 275 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 283 aa  92.4  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  36.15 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  35.77 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 241 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  40.35 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>