More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3999 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  60.91 
 
 		 799 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  61.04 
 
 		 799 aa  915    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  49.81 
 
 		 772 aa  730    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  50.45 
 
 		 796 aa  738    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  51.86 
 
 		 748 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  59.4 
 
 		 792 aa  925    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  100 
 
 		 782 aa  1574    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  37.95 
 
 		 794 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  34.23 
 
 		 852 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  35.94 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.34 
 
 		 795 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.15 
 
 		 785 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  34.91 
 
 		 785 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  35.92 
 
 		 777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  33.85 
 
 		 841 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.45 
 
 		 841 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  33.87 
 
 		 843 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  35.13 
 
 		 834 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  34.12 
 
 		 845 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  34.68 
 
 		 785 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  34.6 
 
 		 781 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.45 
 
 		 803 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.87 
 
 		 855 aa  439  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  32.85 
 
 		 843 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  33.71 
 
 		 844 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  34.25 
 
 		 840 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 905 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  35.26 
 
 		 788 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.74 
 
 		 821 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.26 
 
 		 854 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.26 
 
 		 864 aa  416  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.14 
 
 		 854 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  33 
 
 		 785 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  34.25 
 
 		 778 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  31.01 
 
 		 887 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.04 
 
 		 856 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.83 
 
 		 829 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.5 
 
 		 780 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.74 
 
 		 857 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.49 
 
 		 804 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  33.29 
 
 		 910 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.62 
 
 		 779 aa  386  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.34 
 
 		 844 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  31.33 
 
 		 798 aa  379  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  32.02 
 
 		 782 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 767 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  29.36 
 
 		 744 aa  324  5e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  27.66 
 
 		 778 aa  322  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.53 
 
 		 769 aa  319  1e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  27.96 
 
 		 773 aa  302  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 763 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.35 
 
 		 767 aa  287  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  28.35 
 
 		 790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.36 
 
 		 751 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.38 
 
 		 770 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.41 
 
 		 770 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  27.74 
 
 		 794 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.76 
 
 		 797 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.31 
 
 		 769 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  27.53 
 
 		 752 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.14 
 
 		 799 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.83 
 
 		 787 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 781 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  25.72 
 
 		 769 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.09 
 
 		 791 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  25.72 
 
 		 768 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  25.72 
 
 		 768 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  25.72 
 
 		 768 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  26.96 
 
 		 786 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  26.96 
 
 		 786 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  27.56 
 
 		 766 aa  266  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 		 769 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.02 
 
 		 765 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  28.77 
 
 		 780 aa  266  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.52 
 
 		 784 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.35 
 
 		 765 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 768 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  26.86 
 
 		 787 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.92 
 
 		 768 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 786 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.86 
 
 		 787 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  25.59 
 
 		 768 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.58 
 
 		 769 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  26.44 
 
 		 769 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  26.44 
 
 		 769 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.08 
 
 		 769 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  25.46 
 
 		 769 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  25.46 
 
 		 769 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.3 
 
 		 750 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  25.46 
 
 		 768 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  25.92 
 
 		 769 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.39 
 
 		 765 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.37 
 
 		 790 aa  260  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.47 
 
 		 805 aa  259  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 770 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 796 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 		 752 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.79 
 
 		 803 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.79 
 
 		 804 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.51 
 
 		 781 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>