More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0431 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  100 
 
 		 497 aa  1027    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  69.76 
 
 		 496 aa  688    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  42.54 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  41.34 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  41.11 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  41.02 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  39.67 
 
 		 495 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  41.72 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  41.39 
 
 		 509 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  40.82 
 
 		 495 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  40.82 
 
 		 500 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  40.37 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.49 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  40.62 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  37.85 
 
 		 508 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  40.08 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  39.55 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  38.87 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  38.43 
 
 		 499 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  38.4 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.5 
 
 		 489 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.7 
 
 		 489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.7 
 
 		 489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  38.57 
 
 		 490 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.58 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.71 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.64 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.1 
 
 		 496 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.23 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.23 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.23 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.26 
 
 		 496 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  38.26 
 
 		 517 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  36.96 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.99 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  38.26 
 
 		 521 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  38.11 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  36.65 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  37.14 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  36.76 
 
 		 483 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  38.98 
 
 		 492 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  37.35 
 
 		 476 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  37.57 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  38.01 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  37.38 
 
 		 492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.89 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  36.49 
 
 		 506 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  36.27 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  36.14 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  35.19 
 
 		 479 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  35.68 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  36.97 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  36.31 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  36.31 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  36.31 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  38.16 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  35.98 
 
 		 504 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.1 
 
 		 522 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  37.96 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  37.96 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  36.69 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  37.96 
 
 		 492 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.1 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  38.88 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  37.3 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  33.94 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  36.03 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.34 
 
 		 531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.55 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  37.05 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  32.06 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  32.06 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  30.71 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  32.58 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  37.04 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  35.79 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.92 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  31.56 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  32.59 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  32 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.8 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  34.76 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.56 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  35.16 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  32.3 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  31.74 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  45.27 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  45.27 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  34.36 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  45.27 
 
 		 489 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  30.02 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.68 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  32.99 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  32.33 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  29.66 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  32.74 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  31.97 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  30.8 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  28.83 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  32.02 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>