More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2454 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 161 aa  326  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  52.56 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  52.5 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  50.63 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  48.7 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  51.8 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.84 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  45.39 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  47.95 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  45.33 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  45.28 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  43.7 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  40.54 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 358 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  45.83 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 357 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 176 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  39.61 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  44.78 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  50.77 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 359 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  46.48 
 
 		 359 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 202 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  42.18 
 
 		 358 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  41.48 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  41.48 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  41.48 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>