More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0576 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 313 aa  636    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  78.85 
 
 		 319 aa  526  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  78.46 
 
 		 318 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  80.48 
 
 		 320 aa  488  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  58.9 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  55.87 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  53.92 
 
 		 313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  50.78 
 
 		 325 aa  300  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  41.46 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  41.74 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  34.14 
 
 		 415 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.34 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.57 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 		 423 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 		 423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  32.06 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.53 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.98 
 
 		 415 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  31.56 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  32.39 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 		 389 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.86 
 
 		 468 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 377 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 		 438 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.47 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.97 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.67 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.98 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 		 662 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 		 414 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 		 454 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 		 632 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.04 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  33.33 
 
 		 489 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.26 
 
 		 404 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 		 370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 		 657 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.59 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.53 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  36.45 
 
 		 443 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  28.99 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 		 424 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 		 671 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  37.57 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  37.57 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.08 
 
 		 431 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.4 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 		 474 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.56 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  36.78 
 
 		 434 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  38.24 
 
 		 406 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  29.51 
 
 		 537 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.48 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  37.93 
 
 		 446 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  31.62 
 
 		 440 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  31.62 
 
 		 440 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.94 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  36.93 
 
 		 438 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>