115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2933 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  591  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  50 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  47.27 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  40.94 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  41.42 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  41.31 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  38.91 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  38.52 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  40.47 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  38.91 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  39.69 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  37.8 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  38.02 
 
 		 269 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  37.78 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  32.2 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  31.68 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  31.11 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  32.41 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  31.3 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  31.3 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  33.58 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  33.59 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  32.69 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  32.69 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  33.21 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  30.27 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  30.27 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  31.17 
 
 		 269 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  30.98 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  30.71 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  29.6 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  29.43 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  26.2 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  26.2 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  24.24 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  24.81 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  22.74 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.1 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2556  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.16 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  29.82 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  17.58 
 
 		 418 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 		 260 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>