57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1963 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1963  SapC  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  33.49 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  33.49 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.8 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  33.33 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  32.47 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  32.13 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  31.25 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.39 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  29.39 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  28.16 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  28.16 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  28.57 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  27.76 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29.27 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  27.53 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  28.27 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  30.35 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  27.27 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.16 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  25.31 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  28.88 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  28.17 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  25.2 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  27.35 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  28.33 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  28.34 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.8 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  28.74 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  26.02 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  22.65 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  28.51 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  26.26 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.84 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  24.49 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  26.32 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  26.84 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.48 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  24.6 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  22.04 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  23.58 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  26.32 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  26.45 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  27.62 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  23.98 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  25.1 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  26.67 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  24.78 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  25.79 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  24.17 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25.21 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  24.35 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.42 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  22.48 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  23.27 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  23.65 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  23.04 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>