58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1370 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  67.54 
 
 		 123 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  36.79 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.8 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  39.22 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  32.64 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  36.21 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  36.94 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  33.77 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  37.74 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.25 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  36.52 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 137 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  31.93 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  34.83 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32.99 
 
 		 132 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  29.09 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 132 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  43.24 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.19 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  30.28 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 135 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.86 
 
 		 148 aa  45.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  33.94 
 
 		 295 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  30.39 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  29.36 
 
 		 136 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  32.95 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  40.54 
 
 		 101 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 147 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  30.21 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  29.13 
 
 		 142 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  35.23 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  30.28 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 98 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  36.26 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  29.7 
 
 		 112 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  33.8 
 
 		 139 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 97 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>