More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04622 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  100 
 
 
292 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.07 
 
 
303 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  53.61 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  51.92 
 
 
295 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  47.93 
 
 
296 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  45.23 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.45 
 
 
275 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.58 
 
 
317 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.2 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.2 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.72 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  26.96 
 
 
308 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.93 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  28.62 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  36.18 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.9 
 
 
581 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  38.52 
 
 
311 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  31.23 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.02 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.02 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.01 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  31.18 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.02 
 
 
313 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  30.63 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.97 
 
 
309 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  29.41 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  29.18 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.64 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.1 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  28.52 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.64 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.67 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.02 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.7 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.29 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.51 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.24 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  28.05 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.39 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  30.56 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  34.16 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.29 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  25.73 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.6 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.17 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.04 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.04 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  28.27 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.73 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  30.15 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  29.52 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.35 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.02 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.46 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  37.4 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  28.21 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  30.27 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  30.27 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.59 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  30.27 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  30.27 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  30.27 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.99 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  34.03 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.68 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  26.81 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.2 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  31.65 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.44 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.43 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.54 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.76 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  30.51 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.49 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.24 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  33.85 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  25.99 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.03 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.38 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.46 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  31.21 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.49 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  29.96 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  25.09 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.33 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  37.4 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  31.72 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.43 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  29.39 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.02 
 
 
569 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.72 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  25.77 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  30.67 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  26.32 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  32.55 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.41 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  28.57 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.24 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>