More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02990 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  100 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  86.62 
 
 		 272 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  86.62 
 
 		 272 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  62.83 
 
 		 283 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  62.83 
 
 		 283 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  61.34 
 
 		 283 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  60.3 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  60.3 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  60.3 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 293 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 293 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 293 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  61.22 
 
 		 277 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  59.33 
 
 		 290 aa  331  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  59.55 
 
 		 271 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 291 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 291 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 291 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  56.18 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  56.06 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  56.02 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  55.68 
 
 		 279 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  55.43 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  55.3 
 
 		 279 aa  294  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  52.83 
 
 		 383 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  60.27 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.2 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.2 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  61.06 
 
 		 250 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  49.62 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  49.62 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  49.62 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.33 
 
 		 281 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  46.95 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  66.89 
 
 		 166 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 180 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  57.84 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.8 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  43.23 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  46.24 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  43.23 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.23 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  45.49 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  45.49 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  62.33 
 
 		 167 aa  208  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.44 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  41.73 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  41.73 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  41.73 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  41.73 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  41.73 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.16 
 
 		 270 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.16 
 
 		 270 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  56.82 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  43.6 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  38.4 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  38.4 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  38.4 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  38.4 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  38.4 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  42.53 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  42.53 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  42.53 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  42.53 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  43.2 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  43.2 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  41.38 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  41.6 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  43.35 
 
 		 289 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  40.15 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  40.15 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  43.35 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  39.62 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  43.35 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>