More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0060 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  100 
 
 
180 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  94.44 
 
 
270 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  91.11 
 
 
270 aa  348  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  91.67 
 
 
269 aa  347  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  69.83 
 
 
279 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  69.83 
 
 
293 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  69.83 
 
 
293 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  69.83 
 
 
293 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  68.72 
 
 
279 aa  275  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  69.83 
 
 
277 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  69.27 
 
 
231 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 
274 aa  271  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  68.16 
 
 
279 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  66.11 
 
 
271 aa  267  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  65 
 
 
291 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  65 
 
 
291 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  65 
 
 
291 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  72.22 
 
 
167 aa  258  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  62.01 
 
 
255 aa  257  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  63.33 
 
 
290 aa  257  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  62.01 
 
 
255 aa  257  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  64.97 
 
 
291 aa  254  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  64.97 
 
 
291 aa  254  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  64.97 
 
 
291 aa  254  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  64.25 
 
 
283 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  64.25 
 
 
283 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  64.25 
 
 
283 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  64.25 
 
 
283 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  64.25 
 
 
283 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  64.25 
 
 
283 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  62.36 
 
 
383 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  64.12 
 
 
283 aa  246  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  64.12 
 
 
283 aa  246  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  64.12 
 
 
283 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  58.29 
 
 
272 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  65.09 
 
 
269 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  59.41 
 
 
267 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  59.41 
 
 
267 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  59.41 
 
 
269 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  64.52 
 
 
166 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  57.14 
 
 
259 aa  222  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  58.29 
 
 
272 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  54.71 
 
 
280 aa  204  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  54.71 
 
 
280 aa  204  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  53.53 
 
 
286 aa  203  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  50.85 
 
 
294 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  50.85 
 
 
294 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  50.85 
 
 
294 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  50.85 
 
 
294 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  50.85 
 
 
294 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  56.47 
 
 
239 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  51.46 
 
 
286 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  49.41 
 
 
280 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  49.41 
 
 
280 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  49.41 
 
 
280 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  65.65 
 
 
250 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  51.16 
 
 
207 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  53.25 
 
 
277 aa  190  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  52.66 
 
 
296 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  52.66 
 
 
296 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
291 aa  189  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  51.76 
 
 
293 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  52.07 
 
 
296 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  52.07 
 
 
296 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  52.07 
 
 
296 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  52.07 
 
 
296 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  51.76 
 
 
293 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  51.76 
 
 
293 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 
289 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 
289 aa  188  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  51.48 
 
 
272 aa  187  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  52.1 
 
 
275 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  52.1 
 
 
275 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  52.1 
 
 
275 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 
289 aa  187  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  51.18 
 
 
293 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  51.18 
 
 
293 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.06 
 
 
286 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.06 
 
 
286 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  50.57 
 
 
272 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.06 
 
 
286 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.06 
 
 
286 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.06 
 
 
286 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  48 
 
 
291 aa  185  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  49.13 
 
 
288 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>