More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1823 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  100 
 
 
270 aa  564  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  100 
 
 
270 aa  564  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  92.59 
 
 
270 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  92.59 
 
 
270 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  92.59 
 
 
270 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  92.59 
 
 
270 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  92.59 
 
 
270 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  53.7 
 
 
281 aa  325  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  66.81 
 
 
232 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  54.07 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  52.06 
 
 
286 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  51.69 
 
 
286 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  50.19 
 
 
291 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  50.19 
 
 
286 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  50.19 
 
 
286 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  50.19 
 
 
286 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  50.19 
 
 
286 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  50.19 
 
 
286 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  50.94 
 
 
286 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  50.94 
 
 
286 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  53.7 
 
 
291 aa  295  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  51.33 
 
 
274 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
286 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  53.36 
 
 
302 aa  293  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  53.36 
 
 
293 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  52.99 
 
 
302 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  52.99 
 
 
293 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.44 
 
 
286 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.44 
 
 
286 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.44 
 
 
286 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.44 
 
 
286 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  50.38 
 
 
285 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.44 
 
 
286 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  50 
 
 
296 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  50 
 
 
296 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  52.26 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  51.88 
 
 
379 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  49.43 
 
 
296 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  49.43 
 
 
296 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  49.43 
 
 
296 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  49.43 
 
 
296 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  51.88 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  51.88 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  50 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  51.88 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  51.88 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  51.13 
 
 
272 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  47.74 
 
 
272 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  48.5 
 
 
275 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  50.75 
 
 
272 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  50.75 
 
 
272 aa  279  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  50.75 
 
 
272 aa  279  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  50.75 
 
 
272 aa  279  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  50.75 
 
 
272 aa  279  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  51.29 
 
 
272 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  51.33 
 
 
272 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  48.52 
 
 
289 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  48.52 
 
 
289 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  48.52 
 
 
289 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  47.78 
 
 
279 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  47.78 
 
 
279 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  51.49 
 
 
287 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  47.78 
 
 
279 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  48.5 
 
 
285 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  46.62 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  48.88 
 
 
278 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  45.96 
 
 
291 aa  270  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  45.96 
 
 
291 aa  270  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  47.55 
 
 
275 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  47.55 
 
 
275 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  47.55 
 
 
275 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
289 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
289 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>