More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4972 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  99.3 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  99.65 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  99.65 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  99.65 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  99.3 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  96.85 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  96.85 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  63.86 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  63.86 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  63.86 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  63.86 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  63.86 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  62.59 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  59.86 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4159  putative transposase  99.39 
 
 		 176 aa  331  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  52.06 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  52.06 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  53.53 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  53.53 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  53.53 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  53.53 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  53.53 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.82 
 
 		 281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  50.88 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  50.88 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  50.88 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  50.88 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.12 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  45.3 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  45.3 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  45.3 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  45.3 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  45.3 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  47.02 
 
 		 291 aa  271  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  46.58 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  49.82 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  49.82 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  49.65 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  47.87 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  47.87 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  50.69 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  50.69 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  50.69 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  50.69 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  50.69 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  50.34 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  46.45 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  46.45 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  46.5 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  47.16 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  47.31 
 
 		 291 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  47.31 
 
 		 291 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  48.94 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  49.25 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  46.98 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  46.21 
 
 		 280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  46.98 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  46.98 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  46.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  46.21 
 
 		 280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  44.83 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  46.21 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  46.1 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  46.1 
 
 		 293 aa  251  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  45.1 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  45.1 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  45.1 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  44.83 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  43.1 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  46.98 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  46.98 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  46.98 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  46.98 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  46.98 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  46.98 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>