More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0610 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  64.6 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  64.6 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  64.6 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  64.34 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  61.71 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  61.71 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  61.71 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  62.36 
 
 		 270 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 274 aa  354  8.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  62.73 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  59.86 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  62.64 
 
 		 270 aa  346  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  61.99 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  60.89 
 
 		 279 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  59.41 
 
 		 279 aa  331  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  59.41 
 
 		 279 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  58.3 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  58.3 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  58.3 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  54.21 
 
 		 383 aa  321  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  55.93 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  56.13 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  56.13 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 231 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.51 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.51 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  55.06 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  53.76 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  53.76 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  53.76 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  56.82 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  59.52 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  56.14 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  65.46 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  49.08 
 
 		 286 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  64.25 
 
 		 180 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  51.91 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.59 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.59 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  68.59 
 
 		 167 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  46.47 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  45.95 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  42.26 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  41.52 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  41.52 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  41.52 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  42.96 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  42.96 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  42.96 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.44 
 
 		 286 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.44 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.44 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.44 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.44 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.45 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  42.96 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  42.96 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  42.96 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.77 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.77 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>