More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2905 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  79.37 
 
 		 286 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  69.93 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  69.93 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1456  integrase catalytic region  66.06 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0392097 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  71.14 
 
 		 203 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  46.45 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  47.39 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  47.39 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  47.39 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  46.3 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  46.5 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  46.5 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  46.5 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  46.5 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  47.02 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  47.02 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  47.02 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  46.18 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  46.18 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  46.18 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  47.78 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  45.39 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  45.39 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  45.39 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  44.88 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  44.88 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  45.39 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  45.39 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  45.05 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  48.41 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  47.45 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  44.37 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  44.37 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  47.27 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  47.81 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  47.81 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  40.21 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  40.21 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  40.21 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  40.21 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  40.21 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  46.13 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  45.21 
 
 		 270 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  45.21 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.96 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  44.33 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  44.33 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  46.62 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  45.28 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  44.74 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  46.21 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  46.21 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  46.21 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  44.49 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  44.33 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  46.13 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  45.28 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.96 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  47.31 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  43.62 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  44.41 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  44.41 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  44.41 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>