More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0435 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  93.7 
 
 
269 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  94.07 
 
 
270 aa  531  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  69.89 
 
 
279 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  68.4 
 
 
279 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  67.66 
 
 
279 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  65.56 
 
 
290 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  65.56 
 
 
293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  65.56 
 
 
277 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  65.56 
 
 
293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  65.56 
 
 
293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  64.21 
 
 
271 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  62.73 
 
 
291 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  62.73 
 
 
291 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  62.73 
 
 
291 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 
180 aa  359  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  62.73 
 
 
274 aa  358  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  62.36 
 
 
283 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  62.36 
 
 
283 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  62.36 
 
 
283 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  62.36 
 
 
283 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  62.36 
 
 
283 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  62.36 
 
 
283 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  63.12 
 
 
291 aa  348  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  63.12 
 
 
291 aa  348  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  63.12 
 
 
291 aa  348  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  59.48 
 
 
383 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  62.12 
 
 
283 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  62.12 
 
 
283 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  61.42 
 
 
255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  61.42 
 
 
255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  60.61 
 
 
283 aa  331  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  64.94 
 
 
231 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  61.98 
 
 
269 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  56.93 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  56.18 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  55.77 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  55.77 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  55.77 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  56.93 
 
 
272 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  60.44 
 
 
250 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  74.07 
 
 
167 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  49.03 
 
 
280 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  49.03 
 
 
280 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  48.28 
 
 
286 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  47.51 
 
 
272 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  52.77 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  60.31 
 
 
252 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  45.83 
 
 
288 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.89 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.21 
 
 
286 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  46.47 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  44.49 
 
 
277 aa  231  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  66.45 
 
 
166 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  46.04 
 
 
272 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  43.23 
 
 
286 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  43.23 
 
 
286 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  43.23 
 
 
286 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  43.35 
 
 
270 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  43.35 
 
 
270 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  45.66 
 
 
272 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  45.66 
 
 
272 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  43.23 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.15 
 
 
286 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  46.83 
 
 
289 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  42.86 
 
 
286 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.15 
 
 
286 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  44.11 
 
 
291 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.15 
 
 
286 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.15 
 
 
286 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.15 
 
 
286 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
293 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
293 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
293 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  46.83 
 
 
280 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
289 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>