More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4709 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  100 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  90.11 
 
 		 283 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  90.11 
 
 		 283 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  97.5 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  99.48 
 
 		 201 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  63.44 
 
 		 290 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  61.7 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  61.7 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  61.7 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  63.37 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  63.24 
 
 		 272 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  59.93 
 
 		 291 aa  361  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  59.93 
 
 		 291 aa  361  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  59.93 
 
 		 291 aa  361  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  63.24 
 
 		 272 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  61.34 
 
 		 259 aa  349  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  60.98 
 
 		 271 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  59.63 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  60.82 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  58.89 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  60.61 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  56.62 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  56.62 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  56.62 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  58.52 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  52.84 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  59.09 
 
 		 270 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  59.09 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  63.44 
 
 		 231 aa  314  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  58.78 
 
 		 255 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  58.78 
 
 		 255 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  90.62 
 
 		 166 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  55.47 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  55.68 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  55.68 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  56.51 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  57.87 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  47.81 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  46.64 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.65 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.65 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  64.12 
 
 		 180 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  47.45 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  56.72 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.53 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.53 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.53 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.53 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.53 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  45.76 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  45.62 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.44 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.44 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  45.62 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  46.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  46.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  46.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  46.15 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  46.15 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  46.15 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  46.15 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  45.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  47.19 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  47.19 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  47.19 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  46.82 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  46.82 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  66.03 
 
 		 167 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  43.53 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>