More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  99.65 
 
 		 286 aa  593  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  64.31 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  64.31 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  64.31 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  63.86 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  64.31 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  64.31 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  63.96 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  63.16 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  60.78 
 
 		 288 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  65.3 
 
 		 271 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  65.02 
 
 		 268 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  59.72 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  62.73 
 
 		 271 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  63.1 
 
 		 271 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  60.15 
 
 		 271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  60.15 
 
 		 271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  60.15 
 
 		 271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  60.15 
 
 		 271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  56.12 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  70.15 
 
 		 207 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  51.3 
 
 		 270 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  51.3 
 
 		 270 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  51.3 
 
 		 270 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  51.3 
 
 		 270 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  51.3 
 
 		 270 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  51.84 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  72.41 
 
 		 194 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.33 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.33 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  47.33 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.48 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  45.26 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  45.26 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  45.26 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  45.26 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  45.26 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  49.3 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  45.96 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  48.94 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  45.77 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 291 aa  265  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  46.26 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  48.13 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.67 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  46.29 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  47.02 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  47.67 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  47.37 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  48.67 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  46.98 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  45 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  45 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  45.69 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  42.96 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>