More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00504 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  99.26 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  86.62 
 
 		 259 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  65.44 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  65.44 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  63.24 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  61.85 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  62.55 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  62.55 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  62.55 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  62.55 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  61.85 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  61.85 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  60.89 
 
 		 290 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  62.59 
 
 		 274 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  61.05 
 
 		 271 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  61.05 
 
 		 291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  61.05 
 
 		 291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  61.05 
 
 		 291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  58.05 
 
 		 279 aa  328  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  55.02 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  56.93 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  56.93 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  64.19 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  55.93 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  55.93 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  55.93 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  55.93 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  55.93 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  55.93 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  56.39 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  56.55 
 
 		 269 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  56.4 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  56.4 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  56.18 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  61.16 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  60.15 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  53.21 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  53.21 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  53.21 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.24 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  59.26 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  46.69 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  46.13 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  60.89 
 
 		 201 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  50.21 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  58.29 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  46.99 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  46.24 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  46.24 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  63.75 
 
 		 166 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  44.24 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  44.24 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  44.24 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  44.24 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  44.24 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  45.99 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  45.28 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  62.18 
 
 		 167 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  44.88 
 
 		 289 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  44.88 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  42.42 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  43.22 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  43.22 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  42.8 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  42.8 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  43.17 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  42.86 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>