More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4257 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  100 
 
 		 271 aa  564  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  76.67 
 
 		 277 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  76.67 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  76.67 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  76.67 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  72.69 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  72.69 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  72.69 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  71.96 
 
 		 274 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  67.78 
 
 		 279 aa  390  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  66.42 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  65.93 
 
 		 279 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  76.19 
 
 		 231 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  64.21 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  63.84 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  63.84 
 
 		 269 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  63.33 
 
 		 291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  63.33 
 
 		 291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  63.33 
 
 		 291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  62.73 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  62.73 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  62.73 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  62.73 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  62.73 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  62.73 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  62.35 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  62.35 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  59.11 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  62.5 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  62.5 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  60.98 
 
 		 283 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  61.05 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  63.88 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  59.92 
 
 		 269 aa  327  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  59.92 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  59.92 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  59.55 
 
 		 259 aa  325  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  60.3 
 
 		 272 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  77.01 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  62.11 
 
 		 250 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 		 180 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  50.76 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  55.32 
 
 		 239 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  71.17 
 
 		 167 aa  259  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  48.85 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  47.89 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  47.89 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  50.4 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  50.4 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  50.4 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  44.49 
 
 		 280 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  44.49 
 
 		 280 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  44.49 
 
 		 280 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.49 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  47.37 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  49.06 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  49.06 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  46.56 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  44.66 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.97 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.97 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  46.79 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  41.82 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  41.82 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  41.82 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  41.82 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  41.82 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  59.89 
 
 		 201 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  46.42 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  46.42 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.97 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.97 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.97 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.97 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  64.52 
 
 		 166 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.97 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.77 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>