More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6034 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.63 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  46.62 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  50 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  50 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  50 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  50.76 
 
 		 271 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  50 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  45.42 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  48.95 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  48.95 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  51.57 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  47.79 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  49.12 
 
 		 291 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.8 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.29 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.29 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.29 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.29 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.33 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.33 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  46.98 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  46.98 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  46.98 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  46.98 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  46.83 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  46.83 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  46.83 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  49.63 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  49.63 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  48.31 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  47.94 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  43.73 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  45.29 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  45.29 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  45.29 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  44.18 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  48.87 
 
 		 267 aa  255  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  48.87 
 
 		 267 aa  255  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  48.87 
 
 		 269 aa  254  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  48.31 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  46.21 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  46.21 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  46.21 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  48.48 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  45.56 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  45.16 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  45.16 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  49.3 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  47.7 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  43.79 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  48.06 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  48.06 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.82 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  48.76 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  48.76 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  48.76 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  48.76 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  48.76 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  43.82 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  43.6 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  42.03 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  46.64 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  43.16 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  42.03 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  42.03 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>