More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5791 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  100 
 
 		 166 aa  349  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  90.62 
 
 		 283 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  90 
 
 		 283 aa  306  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  90 
 
 		 283 aa  306  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  69.62 
 
 		 277 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  72.26 
 
 		 290 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  69.62 
 
 		 293 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  69.62 
 
 		 293 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  69.62 
 
 		 293 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  67.72 
 
 		 231 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  94.02 
 
 		 250 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  66.45 
 
 		 270 aa  230  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  67.1 
 
 		 291 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  67.1 
 
 		 291 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  67.1 
 
 		 291 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  63.75 
 
 		 272 aa  226  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  64.52 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  66.45 
 
 		 291 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  66.45 
 
 		 291 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  66.45 
 
 		 291 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  64.52 
 
 		 279 aa  223  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  66.89 
 
 		 259 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  65.81 
 
 		 274 aa  222  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  63.87 
 
 		 270 aa  222  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  62.58 
 
 		 255 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  62.58 
 
 		 255 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  65.16 
 
 		 269 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  64.52 
 
 		 271 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  64.52 
 
 		 279 aa  218  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  62.18 
 
 		 167 aa  217  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  60.76 
 
 		 383 aa  217  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  59.75 
 
 		 267 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  59.75 
 
 		 269 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  59.75 
 
 		 267 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  63.23 
 
 		 279 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  63.75 
 
 		 272 aa  207  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  60.53 
 
 		 283 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  60.53 
 
 		 283 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  60.53 
 
 		 283 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  60.53 
 
 		 283 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  60.53 
 
 		 283 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  60.53 
 
 		 283 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  61.18 
 
 		 239 aa  198  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  66.23 
 
 		 269 aa  197  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  52.47 
 
 		 286 aa  174  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 280 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 280 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  50.97 
 
 		 294 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  50.97 
 
 		 294 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  50.97 
 
 		 294 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  50.97 
 
 		 294 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  50.97 
 
 		 294 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  52.5 
 
 		 293 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  52.5 
 
 		 293 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  52.5 
 
 		 293 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  57.55 
 
 		 280 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  57.55 
 
 		 289 aa  170  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  53.25 
 
 		 298 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  53.25 
 
 		 298 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  53.25 
 
 		 298 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  51.97 
 
 		 272 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  53.5 
 
 		 286 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  51.88 
 
 		 293 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  51.88 
 
 		 293 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  57.55 
 
 		 289 aa  168  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 295 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 295 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 295 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 295 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  51.88 
 
 		 288 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 295 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 295 aa  167  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  49.69 
 
 		 276 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  50.63 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  50.65 
 
 		 270 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  50.65 
 
 		 270 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  51.63 
 
 		 277 aa  163  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  51.63 
 
 		 291 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  161  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  161  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>