More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1183 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  100 
 
 
276 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  64.42 
 
 
294 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  64.42 
 
 
294 aa  364  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  64.42 
 
 
294 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  64.42 
 
 
294 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  64.42 
 
 
294 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  60.44 
 
 
275 aa  360  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  60.44 
 
 
275 aa  360  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  60.44 
 
 
275 aa  360  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.96 
 
 
281 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  47.01 
 
 
270 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  47.01 
 
 
270 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  47.39 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  47.39 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  47.39 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  47.39 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  47.39 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  44.19 
 
 
296 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  44.19 
 
 
296 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  47.92 
 
 
295 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  47.92 
 
 
295 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  47.92 
 
 
295 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  47.92 
 
 
295 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  47.92 
 
 
295 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  47.92 
 
 
295 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  42.55 
 
 
296 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  42.55 
 
 
296 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  42.55 
 
 
296 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  42.55 
 
 
296 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.03 
 
 
286 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.03 
 
 
286 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.03 
 
 
286 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.03 
 
 
286 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.03 
 
 
286 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
293 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
293 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  46.24 
 
 
293 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
298 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
298 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
298 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  46.24 
 
 
293 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  46.24 
 
 
293 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  45.59 
 
 
293 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  45.59 
 
 
302 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  47.57 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  45.59 
 
 
302 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  45.59 
 
 
293 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  47.57 
 
 
289 aa  234  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  43.75 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  43.75 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  47.01 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  47.74 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  43.49 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  43.49 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  43.87 
 
 
286 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  43.33 
 
 
289 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  43.49 
 
 
286 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  43.33 
 
 
289 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  43.33 
 
 
289 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  45.04 
 
 
274 aa  228  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  45.04 
 
 
286 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.33 
 
 
200 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
297 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 
271 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 
271 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 
271 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 
271 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  41.26 
 
 
271 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  41.26 
 
 
271 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  42.22 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 
272 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  42.59 
 
 
284 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0775486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>