More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2466 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  80.6 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  80.6 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  80.6 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  62.41 
 
 
293 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  62.41 
 
 
293 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  62.41 
 
 
293 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  62.41 
 
 
277 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  63.88 
 
 
271 aa  355  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  61.65 
 
 
290 aa  353  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  61.05 
 
 
291 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  61.05 
 
 
291 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  61.05 
 
 
291 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  61.98 
 
 
270 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  61.98 
 
 
270 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  62.36 
 
 
269 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  61.8 
 
 
274 aa  334  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  59.77 
 
 
279 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  59.02 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  60.15 
 
 
272 aa  328  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  58.36 
 
 
283 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  58.36 
 
 
283 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  57.89 
 
 
279 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  56.51 
 
 
283 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  59.52 
 
 
283 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  59.52 
 
 
283 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  59.52 
 
 
283 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  59.52 
 
 
283 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  59.52 
 
 
283 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  59.52 
 
 
283 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  62.78 
 
 
231 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  56.02 
 
 
383 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  60.15 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  58.56 
 
 
259 aa  304  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  58.3 
 
 
255 aa  299  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  58.3 
 
 
255 aa  299  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  53.96 
 
 
269 aa  293  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  53.96 
 
 
267 aa  293  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  53.96 
 
 
267 aa  293  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  57.46 
 
 
250 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  65.09 
 
 
180 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  46.62 
 
 
286 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  57.07 
 
 
252 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.32 
 
 
280 aa  234  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.32 
 
 
280 aa  234  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.35 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  48.43 
 
 
289 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  48.43 
 
 
280 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  67.1 
 
 
167 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  48.43 
 
 
289 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  49.57 
 
 
239 aa  228  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  43.62 
 
 
272 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  45.69 
 
 
288 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  44.91 
 
 
281 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  45.21 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  66.23 
 
 
166 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  44.44 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  44.44 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  43.61 
 
 
280 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  43.61 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  43.61 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  43.23 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  43.23 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  43.23 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  43.23 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  43.23 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.17 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.59 
 
 
270 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.59 
 
 
270 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.38 
 
 
286 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.38 
 
 
286 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.38 
 
 
286 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.38 
 
 
286 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.02 
 
 
286 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
289 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
289 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  43.66 
 
 
288 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 
289 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.38 
 
 
291 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0876  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
286 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  42.75 
 
 
278 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  43.28 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  43.28 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  43.28 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>