More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3327 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  100 
 
 
280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  100 
 
 
280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  71.33 
 
 
286 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  69.93 
 
 
286 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1456  integrase catalytic region  64.22 
 
 
237 aa  308  9e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0392097 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  71.12 
 
 
203 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.04 
 
 
281 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  46.52 
 
 
290 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  49.63 
 
 
288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  47.65 
 
 
293 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  47.65 
 
 
293 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  47.65 
 
 
293 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44.98 
 
 
270 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  49.03 
 
 
270 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  46.57 
 
 
286 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  46.57 
 
 
286 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  46.57 
 
 
286 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  46.57 
 
 
286 aa  254  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  46.21 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  46.57 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  45.49 
 
 
286 aa  251  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  45.49 
 
 
286 aa  251  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  48.3 
 
 
277 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  46.81 
 
 
291 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  46.81 
 
 
291 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  46.81 
 
 
291 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  47.92 
 
 
267 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 
270 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  44.81 
 
 
383 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  47.57 
 
 
269 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  47.92 
 
 
267 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  46.38 
 
 
283 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  46.38 
 
 
283 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  48.26 
 
 
269 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  45.65 
 
 
283 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  45.76 
 
 
296 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  45.76 
 
 
296 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  45.76 
 
 
296 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  45.76 
 
 
296 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  46.97 
 
 
279 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.29 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.29 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.29 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.29 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  47.92 
 
 
274 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.29 
 
 
286 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  45.9 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  45.59 
 
 
283 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  45.59 
 
 
283 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  45.59 
 
 
283 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  45.59 
 
 
283 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  46.42 
 
 
279 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  45.59 
 
 
283 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  45.32 
 
 
277 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  45.59 
 
 
283 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  45.93 
 
 
291 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  45.93 
 
 
291 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  45.93 
 
 
291 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  46.79 
 
 
279 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  43.82 
 
 
283 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  47.89 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  45.25 
 
 
289 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  45.25 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  44.65 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  44.65 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  45.25 
 
 
289 aa  238  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  44.44 
 
 
272 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  44.96 
 
 
289 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  44.96 
 
 
289 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  44.96 
 
 
289 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  46.67 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  43.51 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  40.5 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  40.5 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  40.5 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  40.5 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  44.8 
 
 
296 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>