More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1432 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  99.29 
 
 
289 aa  577  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  99.64 
 
 
289 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0876  Integrase catalytic region  61.15 
 
 
286 aa  344  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  49.44 
 
 
291 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  49.44 
 
 
291 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  49.44 
 
 
291 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  47.45 
 
 
290 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  48.18 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  48.18 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  48.18 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 
274 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  49.62 
 
 
277 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  49.25 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  49.25 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  49.25 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.22 
 
 
281 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.25 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.25 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
271 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  44.4 
 
 
286 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  44.7 
 
 
383 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  46.86 
 
 
283 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  46.86 
 
 
283 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  48.02 
 
 
269 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  48.02 
 
 
267 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  48.02 
 
 
267 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.04 
 
 
288 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  44.62 
 
 
272 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  45.35 
 
 
283 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  45.35 
 
 
283 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  45.95 
 
 
283 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  45.35 
 
 
283 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  45.35 
 
 
283 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  45.35 
 
 
283 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  45.35 
 
 
283 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  46.15 
 
 
270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  41.81 
 
 
286 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 
270 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  44.88 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  44.02 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  43.7 
 
 
286 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  43.7 
 
 
286 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  43.7 
 
 
286 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  43.24 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  46.18 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  42.91 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  43.7 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  44.13 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.42 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  46.03 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  48.43 
 
 
269 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.98 
 
 
255 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.98 
 
 
255 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  49.53 
 
 
231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 
279 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  41.91 
 
 
296 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  44.88 
 
 
272 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  39.47 
 
 
294 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  39.47 
 
 
294 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  39.47 
 
 
294 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  39.47 
 
 
294 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  39.47 
 
 
294 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  45.34 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  40.15 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  41.54 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  43.2 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  40.48 
 
 
278 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  40.68 
 
 
296 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.55 
 
 
286 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.55 
 
 
286 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.55 
 
 
286 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.55 
 
 
286 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>