More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1533 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  100 
 
 		 291 aa  607  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  100 
 
 		 291 aa  607  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  100 
 
 		 291 aa  607  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  86.13 
 
 		 274 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  68.73 
 
 		 293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  68.73 
 
 		 293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  68.73 
 
 		 293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  69.31 
 
 		 277 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  72.69 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  62.89 
 
 		 290 aa  407  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  64.86 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  63.38 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  63.38 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  63.38 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  63.04 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  62.09 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  62.09 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  61.85 
 
 		 272 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  62.73 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  59.93 
 
 		 283 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  61.96 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  61.99 
 
 		 270 aa  359  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  61.62 
 
 		 269 aa  355  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  68.4 
 
 		 231 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  60.3 
 
 		 259 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  61.11 
 
 		 272 aa  341  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  52.25 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  58.04 
 
 		 255 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  58.04 
 
 		 255 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  61.05 
 
 		 269 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  57.46 
 
 		 269 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  57.46 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  57.46 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  65.87 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  58.82 
 
 		 250 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  48.41 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  65 
 
 		 180 aa  265  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  54.04 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  49.44 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  49.44 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  49.44 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.91 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  46.18 
 
 		 286 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.86 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.82 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.82 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.82 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.82 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  44.33 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  66.87 
 
 		 167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  42.75 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  43.54 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  43.54 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.93 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.93 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  43.49 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  44.13 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  44.13 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  40.99 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  43.62 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  43.62 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  43.62 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  43.62 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  46.15 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  44.06 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  42.05 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  42.66 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  43.71 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>