More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0545 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  99.65 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  99.29 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0876  Integrase catalytic region  59.93 
 
 		 286 aa  349  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  47.45 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  48.18 
 
 		 293 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  48.18 
 
 		 293 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  48.18 
 
 		 293 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  49.62 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.61 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.25 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.25 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  44.4 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  50.4 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  46.86 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  46.86 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  44.7 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.04 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  48.02 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  48.02 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  48.02 
 
 		 269 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  44.62 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  45.35 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  45.95 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  43.28 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  45.28 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  46.83 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  44.07 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  44.07 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  44.07 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  43.33 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  44.07 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  43.33 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  43.7 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  41.75 
 
 		 291 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  44.02 
 
 		 279 aa  215  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  46.18 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  43.24 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  44.13 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  46.03 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  48.43 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.98 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.98 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  49.53 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  45.28 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  43.6 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  41.91 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  39.47 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  39.03 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  39.47 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  39.47 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  39.47 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  45.34 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.3 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.3 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.3 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.3 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.3 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  41.11 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  40.68 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>