More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1212 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  100 
 
 		 278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  48.5 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  48.5 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  48.5 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  48.5 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  48.5 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  48.88 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  48.88 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  48.31 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.69 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.69 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.69 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.69 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.69 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  47.17 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  44.15 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  42.7 
 
 		 281 aa  244  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  45.45 
 
 		 290 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  44.74 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  43.49 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  43.49 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  46.47 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  43.49 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  45.49 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  43.07 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  44.78 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  44.78 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  44.78 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  44.78 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 271 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  42.22 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  42.22 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  42.22 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  42.22 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  42.22 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  43.61 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  41.48 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  41.48 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  41.48 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  41.48 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  45.76 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  45.76 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  46.1 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  46.1 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  46.1 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  46.1 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  46.1 
 
 		 298 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  46.1 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  41.11 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  45.39 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  43.23 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  43.23 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  43.23 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  45.72 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  41.85 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  41.85 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  41.51 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  41.64 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  41.89 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  43.02 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  44.94 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  44.94 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  44.94 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  44.94 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  41.89 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  43.66 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  42.44 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  42.44 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  42.44 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  42.91 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.91 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>