More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3089 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  51.01 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  51.83 
 
 
304 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  51.16 
 
 
304 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0410  integrase, catalytic region  91.85 
 
 
141 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  44.77 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.91 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  45.04 
 
 
291 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  45.55 
 
 
286 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  45.55 
 
 
286 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  45.55 
 
 
286 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  45.55 
 
 
286 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  41.79 
 
 
291 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  45.55 
 
 
286 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
270 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
270 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
270 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
270 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
270 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  41.98 
 
 
294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  41.98 
 
 
294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  41.98 
 
 
294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  41.98 
 
 
294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  41.98 
 
 
294 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  42.96 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  43.07 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  43.62 
 
 
286 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  43.62 
 
 
286 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  43.62 
 
 
286 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  43.77 
 
 
289 aa  225  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  43.26 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  43.62 
 
 
286 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  42.45 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  42.45 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  42.2 
 
 
286 aa  222  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  42.2 
 
 
286 aa  222  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.07 
 
 
288 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  38.83 
 
 
293 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  41.99 
 
 
289 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  38.83 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  42.35 
 
 
286 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  43.23 
 
 
271 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.97 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  37.94 
 
 
386 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  37.94 
 
 
386 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  37.94 
 
 
386 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  37.94 
 
 
386 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  37.94 
 
 
386 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  39.66 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  37.94 
 
 
386 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  38.49 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  38.49 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  43.46 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  43.91 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  43.91 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  38.43 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  42.48 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>